A pitiose é uma doença granulomatosa causada pelo oomiceto Pythium insidiosum, transmitida pelo contato direto com zoósporos em ambientes aquáticos e pantanosos, afetando principalmente equinos e seres humanos. Dada a presença de condições climáticas e geográficas favoráveis à disseminação desse agente etiológico na mesorregião norte do estado do Maranhão, este estudo investigou a ocorrência da pitiose na região, por meio de análises clínicas, histopatológicas e moleculares. Foram avaliados 23 equinos com lesões sugestivas de pitiose, provenientes de sete municípios da Baixada Maranhense e dois adjacentes. Fragmentos de tecido ulcerativo e/ou kunkers foram coletados para cultura microbiológica e análise histopatológica. As amostras foram cultivadas em meio ágar levedura, incubadas a 37°C e as colônias analisadas macro e microscopicamente. O exame histopatológico utilizou técnicas de coloração, como hematoxilina e eosina (HE), Grocott (GMS) e ácido periódico de Schiff (PAS), para confirmar a presença de hifas e caracterizar as lesões. Na análise molecular, os isolados foram submetidos à extração de DNA e à PCR utilizando primers específicos para o gene ITS de P. insidiosum. Em seguida, os produtos amplificados foram purificados e sequenciados para análise filogenética. Clinicamente, as lesões estavam localizadas predominantemente nos membros torácicos, pélvicos e região abdominal, caracterizadas por bordas irregulares, inflamação exacerbada e secreção serossanguinolenta. Os resultados revelaram que cinco amostras foram positivas na cultura microbiológica, com colônias típicas apresentando crescimento ramificado e hifas cenocíticas, hialinas e desprovidas de corpos frutíferos. No histopatológico, cortes corados confirmaram lesões granulomatosas associadas à presença de hifas em cinco equinos. Na PCR, quatro isolados foram positivos para P. insidiosum, apresentando produto amplificado de aproximadamente 580 pb. Conclui-se que a pitiose equina ocorre no Maranhão, especialmente na Baixada Maranhense, com características clínicas, histopatológicas e moleculares que reforçam a necessidade de vigilância e controle dessa enfermidade emergente em equinos.